让我们先从农业这件事情来看，农业自古以来就是人类改变原始地景地貌与生态环境，改成种植自己所需求作物的一种行为，进而使耕作区与其附近的环境共同演替成以作物为主的生态环境，也就是所谓的农田生态系。

但自从大航海时代开始，世界重要的作物开始在全球流通种植，也因此促进工业化生产时代的来临，原先世界各地保有原始农业样貌及生态环境的地区，都因植入资本主义的工业化生产，而逐渐开垦成符合全球需要的种植作物类别，例如像是早期的香料、咖啡、可可、橡胶、烟草以及今日的玉米、大豆、油棕梠、香蕉等作物，使得当地原本的农业生态样貌被破坏殆尽，纵使这些作物都是用现行各国的有机法规种植，其作物类别与生产方式已经脱离了当地特有的生态运作模式。

我们大多都知道在生态概念里表现生物多样性的一种方式叫做食物网 ，而构成农田食物网最基层的生物种类就是虫、草，当然还有作物，而土则是孕育出健康作物和野草多样性的重要因素，生活在土里的各种生物组成的土壤生物多样性更是土壤优良的重要关键。

农田生态三要素的虫包含了昆虫、蜘蛛和其余的软件或节肢动物，把虫摆第一是因为虫最直接也最容易反映耕作模式所带来的生态变化，维持丰富的虫多样性将会带来许多田间生态服务，像是抑制害虫或是增加结果率等，而且这些虫又可当作食物网的基础食物用来吸引蛙类、爬虫类、鸟类等生物前来栖息。

而草则是指野草的多样性，野草同时扮演着虫的食物来源以及许多动物的栖所，而对于土壤来说也提供了保湿、固定、和供给土壤微生物的营养来源，而在野草当中又以会开花的蜜源植物、表土固定植物以及会固氮的豆科植物为首选，草的许多概念其实也跟近年来台南农改场在推行的草生栽培有异曲同工之妙。

而土壤则是农田环境与作物是否健康的关键，可把土壤之于作物想象成肠道益菌之于人体，把肠道益菌养好就可使人提高免疫力并远离许多疾病，而养好土壤的微生物与建立丰富的土壤生物多样性，同样可以使作物长的健康，原因在于丰富的土壤生物多样性可抑制有害生物侵袭作物、土壤微生物可制造许多团块使土壤保有较好的通气与保湿性、土壤生物与附近有机质的生物作用可提供微量元素给作物使用，基于这些功能，健康的土除了可以生产出健康的作物之外，也是造就丰富生态系的基石。

上述的虫、草、土是农田生态最基本的考量因素，如需完整评估有机农业中的各种生态因子则还须纳入地理环境、作物种类、施作方法、使用资材、土地使用历史等，进行综合的完整评估，才能得以建构出各种有机农业管理方法所缺乏的生态要件。

像是在坪林的某有机茶园里，虽然此茶园已经施行有机好几年且对有机施作相当纯熟，在有机茶里算是小有名气的，但实际与茶农聊过之后才知道他们的茶叶一直为椿象叮咬所苦，如果仔细看一下地面与附近环境就可以知道，草的多样性很低，也连带着其余生物多样性低，而造成害虫始终无法有效压制其数量，其实早期这种茶园为了防止土壤冲刷而种植固定表土的野草，但时至今日，固定表土已非首要目标，而是营造更多的野草和土壤生物多样性，农田生态的建立是需要与时俱进的。

此外，现今许多有机农业的种植是为了符合全球化或是市场的商业需求，势必会尽可能的提高单位面积生产量，而这样的结果最后还是回归到使用大量有机肥料，使得土壤的营养份失衡，导致土壤生物多样性的平衡瓦解，只徒留少数几种生物甚至是有害生物。

试想超市或卖场买到进口有机包心莴苣，那边的产地除了莴苣之外还会有丰富的野草、昆虫和动物栖息？还是只有莴苣、莴苣和莴苣？

再者，求产量将会使可耕作面积使用最大化，作物种植密集且无野草多样性的生存空间，更别提保留农田周遭的自然栖地，当然虫以及其他动物的多样性也为之消失，生物多样性提供的农田生态服务也随之消逝，反而还要增加使用有机防治资材，而这些资材除了是个负担挺大的成本外，对于许多生物与环境也不一定是无害的。

最后，现今有机农业用生态的角度来看是远远不足，而如何在生产与生态之间达到平衡则是有机农业未来应该要正视的议题。